El doctorado en Antropología Social del CIESAS Sureste ofrece una formación enfocada en la investigación científica básica, centrada en experiencias interdisciplinarias entre las formas convencionales de trabajo (estudio de campo localizado, investigación cualitativa, enfoque etnográfico), así como en métodos y procedimientos de ciencias afines en las que el Centro tiene experiencia: Historia, Medicina Social, Estudios Rurales, Demografía, Sociología, Geografía y Ciencias Políticas.